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為什麼不能說新型冠狀病毒屬於SARS冠狀病毒?

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來源:AP美聯社

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昨晚,也許有不少人對於新型冠狀病毒的分類產生了一些疑問。為什麼我們不能說新型冠狀病毒屬於SARS冠狀病毒?新型冠狀病毒到底「新型」在哪裡?同樣屬於冠狀病毒,它和SARS冠狀病毒又有什麼關係呢?為了解答這些問題,我們得先從冠狀病毒談起。

2019-nCoV 和SARS-CoV 之間是啥關係?

冠狀病毒是一大類在自然界廣泛存在的病毒的總稱。冠狀病毒最早於1968年被發現,並於1975年被國際病毒命名委員會正式命名冠狀病毒科。

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人冠狀病毒的分佈

冠狀病毒直徑約80~120nm,在電鏡下可以觀察到它們的表面有類似日冕的放射狀突起,就像王冠一樣,故而被命名為冠狀病毒。

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新型冠狀病毒的電子顯微鏡照片

冠狀病毒基因組的5′ 端具有甲基化的帽狀結構,3′ 端具有poly(A) 尾,基因組全長約27-32kb,是目前已知RNA病毒中基因組最大的病毒。

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α、β、γ屬冠狀病毒的基因組結構

從系統分類的角度,冠狀病毒屬於網巢病毒目(Nidovirales),冠狀病毒科(Coronaviridae),冠狀病毒屬(Coronavirus)。

根據系統發生分析,我們可以將冠狀病毒分為四個屬:α、β、γ、δ,其中β屬冠狀病毒又可分為四個獨立的亞群A、B、C 和D群。感染哺乳動物的冠狀病毒主要為α、β屬冠狀病毒;感染禽類的冠狀病毒主要來源於γ、δ 屬冠狀病毒。

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迄今為止被發現的冠狀病毒中(包括本次發現的2019-nCoV),目前只發現7 種可以讓人類感染。其中,HCoV-229E 和HCoV-NL63 屬於α 屬冠狀病毒,HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-HKU1 、MERS-CoV 和2019-nCoV 都屬於β 屬冠狀病毒。

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毫無疑問,雖然SARS-CoV和 2019-nCoV兩個病毒都屬於β屬冠狀病毒,但兩者並不等同。

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據第一財經消息,鐘南山院士表示,SARS冠狀病毒是一個專有名詞,是專門指急性呼吸綜合徵的病毒,它(與新型冠狀病毒)不是一回事,這兩個(病毒)是兩回事, 「2019(的)新型冠狀病毒是另外一種病毒,都是屬於冠狀病毒。」

從分類角度來說,2019-nCoV與SARS病毒同屬於冠狀病毒科、冠狀病毒亞科、β冠狀病毒屬、類SARS冠狀病毒種。

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但值得一提的是,國際病毒分類系統也提到,所謂的分種並沒有公認的分類學意義,與我們平時所熟知的「物種」概念並不相同。

準確來說,2019-nCoV 應該是一種SARS相關冠狀病毒。
它倆有多「相關」呢?

全基因組水平相似性約79%

此前一篇《柳葉刀》的文章將2019-nCoV 的完整基因組與已知的冠狀病毒基因組庫進行縱向對比。

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結果發現,2019-nCoV與兩種2018年於中國舟山採集到的蝙蝠來源SARS樣冠狀病毒bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21較為相似相關(相似度88%),但與SARS-CoV(相似度79%)和MERS -CoV(相似度50%)相差較大。

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武漢病毒所石正麗教授在Nature 發表的論文A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin進一步揭示了2019-nCoV與SARS-CoV兩個冠狀病毒的相似性。

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該研究表明,2019-nCoV與SARS-CoV基因組有79.5%的相似性。此外,研究人員還發現該病毒序列與一種雲南的中華菊頭蝠的冠狀病毒在全基因組水平上相似度高達96%,表明蝙蝠可能是2019-nCoV的宿主來源。

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儘管2019-nCov與SARS-CoV相似性僅為79.5%,相差較大,但是在用於病毒鑑別的7個保守域與SARS-CoV的氨基酸相似性高達94.6%,進一步提示其與SARS-CoV屬於同一種屬。

2019-nCoV 可通過ACE2 受體感染細胞

可能還有一些人會注意到,在發布會上有這樣一句話「新型冠狀病毒使用與SARS冠狀病毒相同的細胞進入受體」,怎麼理解呢?

冠狀病毒通過S蛋白與宿主的受體結合,從而感染宿主細胞。冠狀病毒S 蛋白的多樣性高、機制複雜,β 屬冠狀病毒的S 蛋白大小以及在細胞表面與其結合的受體都各不相同。

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一些冠狀病毒的受體

此前一項相關研究對2019-nCoV 的S 蛋白進行了結構三維建模,評估了其與人類ACE2分子相互作用的能力。

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結果表明,儘管存在氨基酸殘基的替換,但2019-nCov 的S 蛋白與人ACE2 受體仍然具有顯著的結合親和力。

石正麗研究團隊進一步確證了2019-nCoV可以通過細胞膜表面ACE2受體進入細胞,這與SARS-CoV進入細胞的途徑是一樣的。而這也從一方面證明了2019-nCoV與SARS-CoV在起源上的密切關係,同屬於SARS相關冠狀病毒。

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結語:

最後讓我們總結一下,SARS-CoV和2019-nCoV兩個病毒都屬於β屬冠狀病毒,但兩者並不等同。

準確來說,2019-nCoV應該是一種SARS相關冠狀病毒,但兩者全基因組水平相似性僅為79.5%,相差較大。

2019-nCoV 可以通過細胞表面ACE2受體進入細胞,這與SARS-CoV 進入細胞的途徑是一樣的。

因此,2019-nCoV是SARS相關病毒,它和SARS-Co有些關係,但它是一個新的病毒,我們不能說它屬於SARS病毒。

原文出處【為什麼不能說新型冠狀病毒屬於SARS冠狀病毒?


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